Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATMINO43313 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATMINO43313 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATMINO43313 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATMINO43313 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ATMINO43313 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATMINO43313 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATMINO43313 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ATMINO43313 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 DLST-216ENST00000626051 252 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC011611.6-201ENST00000547483 255 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATMINO43313 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms