Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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TIMMDC1Q9NPL8 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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TIMMDC1Q9NPL8 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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TIMMDC1Q9NPL8 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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TIMMDC1Q9NPL8 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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TIMMDC1Q9NPL8 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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