Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMG1Q96Q15 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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