Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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CCDC142Q17RM4 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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CCDC142Q17RM4 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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CCDC142Q17RM4 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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CCDC142Q17RM4 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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CCDC142Q17RM4 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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CCDC142Q17RM4 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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CCDC142Q17RM4 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CCDC142Q17RM4 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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