Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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NDUFA9Q16795 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
NDUFA9Q16795 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
NDUFA9Q16795 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
NDUFA9Q16795 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
NDUFA9Q16795 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
NDUFA9Q16795 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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