Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NRF1Q16656 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 270.9 ms