Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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