Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CBFBQ13951 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms