Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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