Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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CDH18Q13634 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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CDH18Q13634 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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CDH18Q13634 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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CDH18Q13634 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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