Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL3Q13618 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms