Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
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TCOF1Q13428 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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TCOF1Q13428 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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TCOF1Q13428 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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TCOF1Q13428 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
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TCOF1Q13428 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TCOF1Q13428 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
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TCOF1Q13428 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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