Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PKHD1P08F94 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
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