Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HLA-DQB1P01920 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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