Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD2APQ9Y5K6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD2APQ9Y5K6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD2APQ9Y5K6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CD2APQ9Y5K6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD2APQ9Y5K6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD2APQ9Y5K6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CD2APQ9Y5K6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD2APQ9Y5K6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD2APQ9Y5K6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CD2APQ9Y5K6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD2APQ9Y5K6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CD2APQ9Y5K6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD2APQ9Y5K6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD2APQ9Y5K6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD2APQ9Y5K6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD2APQ9Y5K6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD2APQ9Y5K6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD2APQ9Y5K6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD2APQ9Y5K6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD2APQ9Y5K6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms