Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC8Q9Y2L5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms