Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP20Q9Y2K6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms