Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNRF3Q9ULT6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms