Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL62

TRPC5, Short transient receptor potential channel 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC5Q9UL62 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC5Q9UL62 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC5Q9UL62 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC5Q9UL62 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC5Q9UL62 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC5Q9UL62 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC5Q9UL62 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC5Q9UL62 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC5Q9UL62 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC5Q9UL62 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC5Q9UL62 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC5Q9UL62 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC5Q9UL62 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC5Q9UL62 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC5Q9UL62 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC5Q9UL62 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC5Q9UL62 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC5Q9UL62 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC5Q9UL62 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC5Q9UL62 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC5Q9UL62 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC5Q9UL62 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC5Q9UL62 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms