Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAPPC2LQ9UL33 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms