Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ORC3Q9UBD5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ORC3Q9UBD5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms