Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARHGEF12Q9NZN5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF12Q9NZN5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms