Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC52A1Q9NWF4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC52A1Q9NWF4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms