Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNPLA3Q9NST1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNPLA3Q9NST1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNPLA3Q9NST1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNPLA3Q9NST1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNPLA3Q9NST1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNPLA3Q9NST1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNPLA3Q9NST1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNPLA3Q9NST1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNPLA3Q9NST1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNPLA3Q9NST1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNPLA3Q9NST1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNPLA3Q9NST1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNPLA3Q9NST1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNPLA3Q9NST1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNPLA3Q9NST1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PNPLA3Q9NST1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNPLA3Q9NST1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNPLA3Q9NST1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNPLA3Q9NST1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PNPLA3Q9NST1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNPLA3Q9NST1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PNPLA3Q9NST1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms