Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOPORSQ9NS56 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms