Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGB3Q9NQW8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms