Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KIAA1549Q9HCM3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms