Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAT1LQ9HCJ6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms