Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLR1EQ9GZS1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms