Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHANK3Q9BYB0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK3Q9BYB0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms