Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRTQ9BXP5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRRTQ9BXP5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms