Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDF4Q9BRK5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms