Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAF11Q99590 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF11Q99590 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms