Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC4A9Q96Q91 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A9Q96Q91 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms