Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A4AQ96JQ5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms