Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRUQ92729 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRUQ92729 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms