Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3AQ92664 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3AQ92664 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3AQ92664 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3AQ92664 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3AQ92664 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3AQ92664 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3AQ92664 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3AQ92664 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3AQ92664 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3AQ92664 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3AQ92664 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF3AQ92664 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF3AQ92664 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF3AQ92664 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF3AQ92664 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF3AQ92664 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF3AQ92664 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF3AQ92664 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3AQ92664 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms