Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC4Q8TBB5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC4Q8TBB5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms