Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC00612Q8N6U2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00612Q8N6U2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms