Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms