Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF2Q8IX21 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms