Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC129Q6ZRS4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms