Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms