Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPOCD1Q6ZMY3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms