Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMARCD3Q6STE5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms