Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD54Q6NXT1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54Q6NXT1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms