Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms