Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms