Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF6Q6KF10 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GDF6Q6KF10 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms