Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCSAPQ6IQ19 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCSAPQ6IQ19 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms